Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms