Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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