Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms