Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms