Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms