Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNB3Q15768 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms