Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms