RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299529.6

CRABP1-201, Transcript of cellular retinoic acid binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRABP1, Length 772 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1-201ENST00000299529 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.87■■■■□ 3.49
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CRABP1-201ENST00000299529 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.41■■■□□ 2.62
CRABP1-201ENST00000299529 NACADO15069 1562 aa31.23■■■□□ 2.59
CRABP1-201ENST00000299529 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.06■■■□□ 2.56
CRABP1-201ENST00000299529 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.87■■■□□ 2.53
CRABP1-201ENST00000299529 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.79■■■□□ 2.52
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CRABP1-201ENST00000299529 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.49■■■□□ 2.47
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CRABP1-201ENST00000299529 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.13■■■□□ 2.41
CRABP1-201ENST00000299529 SCRIBQ14160 1630 aa30.07■■■□□ 2.4
CRABP1-201ENST00000299529 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.74■■■□□ 2.35
CRABP1-201ENST00000299529 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CRABP1-201ENST00000299529 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.67■■■□□ 2.34
CRABP1-201ENST00000299529 NCAPD3P42695 1498 aa28.85■■■□□ 2.21
CRABP1-201ENST00000299529 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.75■■■□□ 2.19
CRABP1-201ENST00000299529 SMARCA4P51532 1647 aa28.72■■■□□ 2.19
CRABP1-201ENST00000299529 SMARCA2P51531 1590 aa28.68■■■□□ 2.18
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CRABP1-201ENST00000299529 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.47■■■□□ 2.15
CRABP1-201ENST00000299529 ERCC6Q03468 1493 aa28.44■■■□□ 2.14
CRABP1-201ENST00000299529 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.39■■■□□ 2.14
CRABP1-201ENST00000299529 CUX2O14529 1486 aa28.38■■■□□ 2.13
CRABP1-201ENST00000299529 NESP48681 1621 aa28.29■■■□□ 2.12
CRABP1-201ENST00000299529 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.25■■■□□ 2.11
CRABP1-201ENST00000299529 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.16■■■□□ 2.1
CRABP1-201ENST00000299529 WIZO95785 1651 aa28.02■■■□□ 2.08
CRABP1-201ENST00000299529 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.01■■■□□ 2.08
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CRABP1-201ENST00000299529 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.97■■■□□ 2.07
CRABP1-201ENST00000299529 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.91■■■□□ 2.06
CRABP1-201ENST00000299529 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CRABP1-201ENST00000299529 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.74■■■□□ 2.03
CRABP1-201ENST00000299529 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CRABP1-201ENST00000299529 WDR62O43379 1518 aa27.67■■■□□ 2.02
CRABP1-201ENST00000299529 CFTRP13569 1480 aa27.66■■■□□ 2.02
CRABP1-201ENST00000299529 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.65■■■□□ 2.02
CRABP1-201ENST00000299529 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.63■■■□□ 2.01
CRABP1-201ENST00000299529 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.4■■□□□ 1.98
CRABP1-201ENST00000299529 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CRABP1-201ENST00000299529 PRDM2Q13029 1718 aa27.33■■□□□ 1.96
CRABP1-201ENST00000299529 TOPBP1Q92547 1522 aa27.11■■□□□ 1.93
CRABP1-201ENST00000299529 IFT140Q96RY7 1462 aa27.11■■□□□ 1.93
CRABP1-201ENST00000299529 ABCC8Q09428 1581 aa27.1■■□□□ 1.93
CRABP1-201ENST00000299529 OSCARQ8IYS5 282 aa27.1■■□□□ 1.93
CRABP1-201ENST00000299529 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.02■■□□□ 1.92
CRABP1-201ENST00000299529 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CRABP1-201ENST00000299529 TRIM41Q8WV44 630 aa27.01■■□□□ 1.91
CRABP1-201ENST00000299529 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CRABP1-201ENST00000299529 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CRABP1-201ENST00000299529 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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CRABP1-201ENST00000299529 SOGA1O94964 1423 aa26.73■■□□□ 1.87
CRABP1-201ENST00000299529 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.72■■□□□ 1.87
CRABP1-201ENST00000299529 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.68■■□□□ 1.86
CRABP1-201ENST00000299529 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.68■■□□□ 1.86
CRABP1-201ENST00000299529 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.68■■□□□ 1.86
CRABP1-201ENST00000299529 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.68■■□□□ 1.86
CRABP1-201ENST00000299529 CUX1P39880 1505 aa26.66■■□□□ 1.86
CRABP1-201ENST00000299529 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CRABP1-201ENST00000299529 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CRABP1-201ENST00000299529 ARHGEF11O15085 1522 aa26.64■■□□□ 1.85
CRABP1-201ENST00000299529 WDR97A6NE52 1622 aa26.63■■□□□ 1.85
CRABP1-201ENST00000299529 CHD1O14646 1710 aa26.62■■□□□ 1.85
CRABP1-201ENST00000299529 FBLN2P98095 1184 aa26.6■■□□□ 1.85
CRABP1-201ENST00000299529 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.53■■□□□ 1.84
CRABP1-201ENST00000299529 GRIN2BQ13224 1484 aa26.49■■□□□ 1.83
CRABP1-201ENST00000299529 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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CRABP1-201ENST00000299529 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.44■■□□□ 1.82
CRABP1-201ENST00000299529 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.41■■□□□ 1.82
CRABP1-201ENST00000299529 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.4■■□□□ 1.82
CRABP1-201ENST00000299529 SYNJ2O15056 1496 aa26.4■■□□□ 1.82
CRABP1-201ENST00000299529 ARAP1Q96P48 1450 aa26.37■■□□□ 1.81
CRABP1-201ENST00000299529 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.37■■□□□ 1.81
CRABP1-201ENST00000299529 SYNJ1O43426 1573 aa26.37■■□□□ 1.81
CRABP1-201ENST00000299529 PBRM1Q86U86 1689 aa26.34■■□□□ 1.81
CRABP1-201ENST00000299529 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
CRABP1-201ENST00000299529 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.33■■□□□ 1.81
CRABP1-201ENST00000299529 TOP2BQ02880 1626 aa26.28■■□□□ 1.8
CRABP1-201ENST00000299529 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.26■■□□□ 1.79
CRABP1-201ENST00000299529 GRIN2AQ12879 1464 aa26.15■■□□□ 1.78
CRABP1-201ENST00000299529 ADAMTS12P58397 1594 aa26.12■■□□□ 1.77
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CRABP1-201ENST00000299529 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.09■■□□□ 1.77
CRABP1-201ENST00000299529 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.08■■□□□ 1.77
CRABP1-201ENST00000299529 NUP160Q12769 1436 aa26.06■■□□□ 1.76
CRABP1-201ENST00000299529 CEP170Q5SW79 1584 aa26.02■■□□□ 1.76
CRABP1-201ENST00000299529 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.93■■□□□ 1.74
CRABP1-201ENST00000299529 SHROOM2Q13796 1616 aa25.91■■□□□ 1.74
CRABP1-201ENST00000299529 JPH4Q96JJ6 628 aa25.8■■□□□ 1.72
CRABP1-201ENST00000299529 KIF27Q86VH2 1401 aa25.8■■□□□ 1.72
CRABP1-201ENST00000299529 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CRABP1-201ENST00000299529 IGF1RP08069 1367 aa25.77■■□□□ 1.72
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