Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms