Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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