Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPL23P62829 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPL23P62829 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPL23P62829 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms