Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB2P29033 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms