Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms