Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms