Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFNKQ9P0W0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNKQ9P0W0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms