Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBQLN4Q9NRR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBQLN4Q9NRR5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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