Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-5Q9HDB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVK-5Q9HDB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms