Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSSK3Q96PN8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms