Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF3C6Q969F1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C6Q969F1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms