Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF40BQ6NWY9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRPF40BQ6NWY9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms