Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 CALML4-207ENST00000478113 3651 ntTSL 1 (best)3.63□□□□□ -1.835e-7■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.934e-6■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.973e-6■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 513.56□□□□□ -0.245e-7■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 PRRC2A-208ENST00000469577 918 ntTSL 513.31□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 38.85□□□□□ -0.995e-6■■■■□ 20.8
NIPBLQ6KC79 ZNF451-215ENST00000509251 513 ntTSL 41.64□□□□□ -2.154e-6■■■■□ 20.8
NIPBLQ6KC79 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.761e-25■■■■□ 20.8
NIPBLQ6KC79 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 412.01□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 20.7
NIPBLQ6KC79 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 20.7
NIPBLQ6KC79 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.82e-6■■■■□ 20.7
NIPBLQ6KC79 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 20.7
NIPBLQ6KC79 TMEM44-207ENST00000430601 682 ntTSL 318.6■□□□□ 0.575e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 TMEM44-205ENST00000419280 1212 ntTSL 516.2■□□□□ 0.185e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.165e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.085e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.135e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 TMEM44-214ENST00000494894 859 ntTSL 314.21□□□□□ -0.145e-6■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 CTTN-205ENST00000415461 1021 ntTSL 317.67■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■■■□ 20.6
NIPBLQ6KC79 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 20.5
NIPBLQ6KC79 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 20.5
NIPBLQ6KC79 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.347e-7■■■■□ 20.5
NIPBLQ6KC79 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 20.5
NIPBLQ6KC79 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 314.71□□□□□ -0.051e-16■■■■□ 20.5
NIPBLQ6KC79 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 29.37□□□□□ -0.911e-16■■■■□ 20.5
NIPBLQ6KC79 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-16■■■■□ 20.5
NIPBLQ6KC79 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-207ENST00000586825 586 ntTSL 323.91■■□□□ 1.422e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-205ENST00000586295 706 ntTSL 322.89■■□□□ 1.262e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.152e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.12e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-202ENST00000355491 803 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.782e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.612e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-204ENST00000585769 988 ntTSL 218.41■□□□□ 0.542e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 317.12■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 LMNA-211ENST00000470199 551 ntTSL 414.86□□□□□ -0.035e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 LMNA-219ENST00000502751 570 ntTSL 414.53□□□□□ -0.085e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-222ENST00000546253 582 ntTSL 414.45□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.275e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-212ENST00000538682 1368 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 STK11-204ENST00000585851 505 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 STK11-209ENST00000593219 637 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 AC084082.1-201ENST00000520930 451 ntTSL 512.02□□□□□ -0.482e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 LMNA-210ENST00000469565 591 ntTSL 411.73□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-212ENST00000579175 867 ntTSL 311.67□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-210ENST00000537839 584 ntTSL 511.38□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-236ENST00000584991 1862 ntTSL 511.17□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-218ENST00000580391 1957 ntTSL 511.07□□□□□ -0.643e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-205ENST00000517904 661 ntTSL 310.94□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-219ENST00000580670 1768 ntTSL 510.7□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 AC084082.1-202ENST00000517961 956 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-237ENST00000585163 2519 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-217ENST00000580287 2609 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-205ENST00000457660 873 ntTSL 59.7□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-209ENST00000511700 582 ntTSL 39.64□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-215ENST00000539891 1300 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC9.48□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-206ENST00000508451 555 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-231ENST00000584063 2759 ntTSL 1 (best)8.61□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP3-232ENST00000584168 2684 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-202ENST00000423695 1232 ntTSL 28.38□□□□□ -1.072e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-209ENST00000537508 583 ntTSL 28.29□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-224ENST00000520522 390 ntTSL 58.17□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-229ENST00000521683 565 ntTSL 48.17□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-203ENST00000517534 416 ntTSL 27.82□□□□□ -1.162e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 DYNC1H1-203ENST00000554854 721 ntTSL 37.72□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.32e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-204ENST00000503454 762 ntTSL 36.8□□□□□ -1.322e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-243ENST00000540387 2684 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 SLC3A2-218ENST00000541649 515 ntTSL 36.67□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-230ENST00000521724 2741 ntTSL 26.65□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 20.4
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 46.4 ms