RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470199.2

LMNA-211, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 4

Gene LMNA, Length 551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNA-211ENST00000470199 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.23■■■■■ 4.51
LMNA-211ENST00000470199 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.27■■■■□ 3.72
LMNA-211ENST00000470199 ABCC9O60706 1549 aa37.52■■■■□ 3.6
LMNA-211ENST00000470199 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.18■■■■□ 3.38
LMNA-211ENST00000470199 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
LMNA-211ENST00000470199 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36■■■■□ 3.35
LMNA-211ENST00000470199 NACADO15069 1562 aa35.98■■■■□ 3.35
LMNA-211ENST00000470199 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.77■■■■□ 3.32
LMNA-211ENST00000470199 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.68■■■■□ 3.3
LMNA-211ENST00000470199 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.24■■■■□ 3.23
LMNA-211ENST00000470199 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
LMNA-211ENST00000470199 SCRIBQ14160 1630 aa35.07■■■■□ 3.21
LMNA-211ENST00000470199 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.02■■■■□ 3.2
LMNA-211ENST00000470199 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.46■■■■□ 3.11
LMNA-211ENST00000470199 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.44■■■■□ 3.1
LMNA-211ENST00000470199 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
LMNA-211ENST00000470199 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.89■■■■□ 3.02
LMNA-211ENST00000470199 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.77■■■■□ 3
LMNA-211ENST00000470199 SMARCA4P51532 1647 aa33.51■■■□□ 2.96
LMNA-211ENST00000470199 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
LMNA-211ENST00000470199 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.38■■■□□ 2.93
LMNA-211ENST00000470199 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.32■■■□□ 2.92
LMNA-211ENST00000470199 NCAPD3P42695 1498 aa33.25■■■□□ 2.91
LMNA-211ENST00000470199 SMARCA2P51531 1590 aa33.2■■■□□ 2.91
LMNA-211ENST00000470199 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.13■■■□□ 2.89
LMNA-211ENST00000470199 HMGXB3Q12766 1538 aa33.05■■■□□ 2.88
LMNA-211ENST00000470199 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
LMNA-211ENST00000470199 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
LMNA-211ENST00000470199 WIZO95785 1651 aa33.02■■■□□ 2.88
LMNA-211ENST00000470199 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
LMNA-211ENST00000470199 NESP48681 1621 aa32.54■■■□□ 2.8
LMNA-211ENST00000470199 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
LMNA-211ENST00000470199 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.31■■■□□ 2.76
LMNA-211ENST00000470199 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.31■■■□□ 2.76
LMNA-211ENST00000470199 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.29■■■□□ 2.76
LMNA-211ENST00000470199 ERCC6Q03468 1493 aa32.24■■■□□ 2.75
LMNA-211ENST00000470199 CFTRP13569 1480 aa32.14■■■□□ 2.74
LMNA-211ENST00000470199 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.1■■■□□ 2.73
LMNA-211ENST00000470199 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.06■■■□□ 2.72
LMNA-211ENST00000470199 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.95■■■□□ 2.7
LMNA-211ENST00000470199 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
LMNA-211ENST00000470199 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.86■■■□□ 2.69
LMNA-211ENST00000470199 CUX2O14529 1486 aa31.81■■■□□ 2.68
LMNA-211ENST00000470199 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.8■■■□□ 2.68
LMNA-211ENST00000470199 PRDM2Q13029 1718 aa31.8■■■□□ 2.68
LMNA-211ENST00000470199 WDR62O43379 1518 aa31.68■■■□□ 2.66
LMNA-211ENST00000470199 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
LMNA-211ENST00000470199 TOPBP1Q92547 1522 aa31.45■■■□□ 2.63
LMNA-211ENST00000470199 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.39■■■□□ 2.61
LMNA-211ENST00000470199 ABCC8Q09428 1581 aa31.34■■■□□ 2.61
LMNA-211ENST00000470199 CUX1P39880 1505 aa31.29■■■□□ 2.6
LMNA-211ENST00000470199 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
LMNA-211ENST00000470199 IFT140Q96RY7 1462 aa31.18■■■□□ 2.58
LMNA-211ENST00000470199 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.15■■■□□ 2.58
LMNA-211ENST00000470199 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
LMNA-211ENST00000470199 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.14■■■□□ 2.57
LMNA-211ENST00000470199 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
LMNA-211ENST00000470199 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.575e-6■■■■■ 29.2
LMNA-211ENST00000470199 SOGA1O94964 1423 aa31.07■■■□□ 2.57
LMNA-211ENST00000470199 SYNJ1O43426 1573 aa31.06■■■□□ 2.56
LMNA-211ENST00000470199 TOP2BQ02880 1626 aa30.99■■■□□ 2.55
LMNA-211ENST00000470199 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.552e-11■■■■■ 40.9
LMNA-211ENST00000470199 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.98■■■□□ 2.55
LMNA-211ENST00000470199 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
LMNA-211ENST00000470199 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
LMNA-211ENST00000470199 WDR97A6NE52 1622 aa30.84■■■□□ 2.53
LMNA-211ENST00000470199 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.81■■■□□ 2.52
LMNA-211ENST00000470199 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.8■■■□□ 2.52
LMNA-211ENST00000470199 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.7■■■□□ 2.51
LMNA-211ENST00000470199 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.68■■■□□ 2.5
LMNA-211ENST00000470199 GRIN2BQ13224 1484 aa30.66■■■□□ 2.5
LMNA-211ENST00000470199 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.65■■■□□ 2.5
LMNA-211ENST00000470199 PBRM1Q86U86 1689 aa30.6■■■□□ 2.49
LMNA-211ENST00000470199 OSCARQ8IYS5 282 aa30.59■■■□□ 2.49
LMNA-211ENST00000470199 FBLN2P98095 1184 aa30.58■■■□□ 2.49
LMNA-211ENST00000470199 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
LMNA-211ENST00000470199 CHD1O14646 1710 aa30.53■■■□□ 2.48
LMNA-211ENST00000470199 TRIM41Q8WV44 630 aa30.48■■■□□ 2.47
LMNA-211ENST00000470199 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
LMNA-211ENST00000470199 SYNJ2O15056 1496 aa30.44■■■□□ 2.46
LMNA-211ENST00000470199 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.42■■■□□ 2.46
LMNA-211ENST00000470199 KIF27Q86VH2 1401 aa30.41■■■□□ 2.46
LMNA-211ENST00000470199 ADAMTS12P58397 1594 aa30.38■■■□□ 2.45
LMNA-211ENST00000470199 IGF1RP08069 1367 aa30.35■■■□□ 2.45
LMNA-211ENST00000470199 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.33■■■□□ 2.45
LMNA-211ENST00000470199 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.33■■■□□ 2.45
LMNA-211ENST00000470199 GRIN2AQ12879 1464 aa30.28■■■□□ 2.44
LMNA-211ENST00000470199 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.25■■■□□ 2.43
LMNA-211ENST00000470199 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.21■■■□□ 2.43
LMNA-211ENST00000470199 CEP170Q5SW79 1584 aa30.16■■■□□ 2.42
LMNA-211ENST00000470199 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.15■■■□□ 2.42
LMNA-211ENST00000470199 NUP160Q12769 1436 aa30.14■■■□□ 2.42
LMNA-211ENST00000470199 CUL7Q14999 1698 aa30.13■■■□□ 2.41
LMNA-211ENST00000470199 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
LMNA-211ENST00000470199 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
LMNA-211ENST00000470199 ARHGEF11O15085 1522 aa30.09■■■□□ 2.41
LMNA-211ENST00000470199 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
LMNA-211ENST00000470199 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
LMNA-211ENST00000470199 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.94■■■□□ 2.38
LMNA-211ENST00000470199 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.91■■■□□ 2.38
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