Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO2Q562F6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO2Q562F6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms