Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TCTN1Q2MV58 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCTN1Q2MV58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms