Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCK2Q16822 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCK2Q16822 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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