Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNXAQ16473 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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TNXAQ16473 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TNXAQ16473 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNXAQ16473 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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