Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPAQ15257 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPAQ15257 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPAQ15257 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPAQ15257 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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