Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBQ06643 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBQ06643 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBQ06643 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBQ06643 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBQ06643 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBQ06643 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBQ06643 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBQ06643 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBQ06643 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTBQ06643 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBQ06643 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBQ06643 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBQ06643 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBQ06643 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTBQ06643 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBQ06643 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBQ06643 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBQ06643 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBQ06643 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBQ06643 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBQ06643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBQ06643 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBQ06643 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBQ06643 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBQ06643 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBQ06643 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBQ06643 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms