Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms