Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A2P55011 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC12A2P55011 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A2P55011 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms