Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX5P35711 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX5P35711 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX5P35711 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX5P35711 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX5P35711 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX5P35711 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX5P35711 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX5P35711 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX5P35711 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX5P35711 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX5P35711 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX5P35711 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX5P35711 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX5P35711 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX5P35711 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX5P35711 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX5P35711 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX5P35711 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX5P35711 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX5P35711 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX5P35711 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX5P35711 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX5P35711 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX5P35711 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX5P35711 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX5P35711 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX5P35711 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX5P35711 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX5P35711 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX5P35711 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX5P35711 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX5P35711 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX5P35711 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX5P35711 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX5P35711 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX5P35711 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX5P35711 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX5P35711 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX5P35711 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX5P35711 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX5P35711 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX5P35711 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX5P35711 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX5P35711 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms