Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SSBP2-211ENST00000509013 709 ntTSL 56.98□□□□□ -1.297e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 26.51□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 SSBP2-206ENST00000506960 685 ntTSL 25.43□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 LINC01237-205ENST00000457686 586 ntTSL 416.22■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 LINC01237-202ENST00000429947 470 ntTSL 415.29■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.651e-11■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.357e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.829e-8■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-216ENST00000589956 594 ntTSL 519.98■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-208ENST00000587654 575 ntTSL 418.08■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-205ENST00000586775 945 ntTSL 317.3■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-214ENST00000589337 541 ntTSL 413.71□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 TNPO2-217ENST00000590781 547 ntTSL 49.75□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 421.27■■□□□ 11e-9■■■■■ 41.4
GTF2F1P35269 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-10■■■■■ 41.4
GTF2F1P35269 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 41.4
GTF2F1P35269 HIP1-206ENST00000485723 419 ntTSL 29.67□□□□□ -0.864e-10■■■■■ 41.4
GTF2F1P35269 DOCK11-204ENST00000633080 6041 ntTSL 53.62□□□□□ -1.839e-8■■■■■ 41.4
GTF2F1P35269 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 TNFRSF1B-203ENST00000492361 3583 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-214ENST00000460905 715 ntTSL 525.64■■□□□ 1.75e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-225ENST00000490803 1865 ntTSL 1 (best)21.64■■□□□ 1.065e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-221ENST00000470987 1954 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.95e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-216ENST00000462571 1784 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-227ENST00000495521 1565 ntTSL 1 (best)20.08■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-215ENST00000460989 1521 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.685e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-220ENST00000468805 1721 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.555e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.555e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-219ENST00000467403 1661 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-228ENST00000497805 1908 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.325e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-223ENST00000486902 794 ntTSL 210.87□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-222ENST00000472401 431 ntTSL 310.87□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 PDE9A-204ENST00000335512 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.75e-8■■■■■ 41.3
GTF2F1P35269 ZDHHC14-205ENST00000422910 2883 ntTSL 216.44■□□□□ 0.226e-20■■■■■ 41.2
GTF2F1P35269 DLG4-205ENST00000451807 926 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 41.2
GTF2F1P35269 DCUN1D4-215ENST00000509068 805 ntTSL 324.73■■□□□ 1.553e-7■■■■■ 41.2
GTF2F1P35269 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)18.39■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 41.2
GTF2F1P35269 GALM-205ENST00000444351 834 ntTSL 516.95■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 41.1
GTF2F1P35269 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 41.1
GTF2F1P35269 GALM-201ENST00000272252 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 41.1
GTF2F1P35269 GALM-204ENST00000434934 724 ntTSL 34.59□□□□□ -1.673e-7■■■■■ 41.1
GTF2F1P35269 NCAPG2-207ENST00000472591 554 ntTSL 412.12□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 41
GTF2F1P35269 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 12e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 SSBP2-208ENST00000507655 845 ntTSL 519.79■□□□□ 0.767e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 29.62□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 27.59□□□□□ -1.197e-7■■■■■ 41
GTF2F1P35269 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.174e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 520.88■□□□□ 0.934e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.874e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 519.62■□□□□ 0.734e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 519.06■□□□□ 0.644e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.564e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.34e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 516.71■□□□□ 0.264e-10■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 ROR2-205ENST00000495386 664 ntTSL 315.49■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 ROR2-206ENST00000546883 501 ntTSL 314.45□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 40.9
GTF2F1P35269 ADCY7-205ENST00000563677 557 ntTSL 410.56□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 MDM2-219ENST00000493419 577 ntTSL 215.46■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 MDM2-204ENST00000311420 1583 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 MDM2-213ENST00000393417 1683 ntTSL 58.71□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 HSF4-218ENST00000522023 636 ntTSL 420.93■□□□□ 0.943e-11■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 222.21■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 421.23■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-208ENST00000587361 579 ntTSL 325.62■■□□□ 1.697e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.357e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.177e-10■■■■■ 40.8
GTF2F1P35269 YIF1B-212ENST00000589644 1917 ntTSL 220.69■□□□□ 0.97e-10■■■■■ 40.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 81.5 ms