Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF4P15884 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF4P15884 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF4P15884 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF4P15884 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF4P15884 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF4P15884 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF4P15884 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF4P15884 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF4P15884 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF4P15884 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF4P15884 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF4P15884 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF4P15884 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF4P15884 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF4P15884 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF4P15884 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF4P15884 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF4P15884 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF4P15884 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF4P15884 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF4P15884 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF4P15884 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF4P15884 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF4P15884 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF4P15884 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF4P15884 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF4P15884 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF4P15884 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms