Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VEGFAP15692 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VEGFAP15692 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VEGFAP15692 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms