Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UCHL3P15374 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UCHL3P15374 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms