Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2F1P10589 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2F1P10589 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms