Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NGFRP08138 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NGFRP08138 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NGFRP08138 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NGFRP08138 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NGFRP08138 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NGFRP08138 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NGFRP08138 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NGFRP08138 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NGFRP08138 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NGFRP08138 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NGFRP08138 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NGFRP08138 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NGFRP08138 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NGFRP08138 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NGFRP08138 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NGFRP08138 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NGFRP08138 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NGFRP08138 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NGFRP08138 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NGFRP08138 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NGFRP08138 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NGFRP08138 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NGFRP08138 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NGFRP08138 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NGFRP08138 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NGFRP08138 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NGFRP08138 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NGFRP08138 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NGFRP08138 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGFRP08138 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGFRP08138 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGFRP08138 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGFRP08138 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NGFRP08138 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGFRP08138 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGFRP08138 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGFRP08138 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGFRP08138 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGFRP08138 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGFRP08138 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NGFRP08138 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGFRP08138 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGFRP08138 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGFRP08138 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGFRP08138 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NGFRP08138 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NGFRP08138 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NGFRP08138 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NGFRP08138 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGFRP08138 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms