Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms