Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF28PB7ZC32 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIF28PB7ZC32 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms