Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF316A6NFI3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZNF316A6NFI3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms