Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms