Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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