Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms