Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCER2I3L3R5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms