Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms