Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTA3Q9BTC8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTA3Q9BTC8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms