Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA4AP68366 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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