Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TUBA4AP68366 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TUBA4AP68366 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TUBA4AP68366 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TUBA4AP68366 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TUBA4AP68366 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUBA4AP68366 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TUBA4AP68366 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBA4AP68366 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TUBA4AP68366 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TUBA4AP68366 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBA4AP68366 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.37
TUBA4AP68366 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBA4AP68366 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBA4AP68366 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TUBA4AP68366 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBA4AP68366 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBA4AP68366 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBA4AP68366 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBA4AP68366 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBA4AP68366 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TUBA4AP68366 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBA4AP68366 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBA4AP68366 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBA4AP68366 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBA4AP68366 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBA4AP68366 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBA4AP68366 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBA4AP68366 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBA4AP68366 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBA4AP68366 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBA4AP68366 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBA4AP68366 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBA4AP68366 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBA4AP68366 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBA4AP68366 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBA4AP68366 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBA4AP68366 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBA4AP68366 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBA4AP68366 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBA4AP68366 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBA4AP68366 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBA4AP68366 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBA4AP68366 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBA4AP68366 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBA4AP68366 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBA4AP68366 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBA4AP68366 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBA4AP68366 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBA4AP68366 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBA4AP68366 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBA4AP68366 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBA4AP68366 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBA4AP68366 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBA4AP68366 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBA4AP68366 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBA4AP68366 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBA4AP68366 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBA4AP68366 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBA4AP68366 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBA4AP68366 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBA4AP68366 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBA4AP68366 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBA4AP68366 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBA4AP68366 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBA4AP68366 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUBA4AP68366 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBA4AP68366 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBA4AP68366 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBA4AP68366 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBA4AP68366 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBA4AP68366 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBA4AP68366 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBA4AP68366 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBA4AP68366 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBA4AP68366 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBA4AP68366 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBA4AP68366 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBA4AP68366 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBA4AP68366 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBA4AP68366 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBA4AP68366 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBA4AP68366 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBA4AP68366 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBA4AP68366 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBA4AP68366 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBA4AP68366 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBA4AP68366 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBA4AP68366 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBA4AP68366 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBA4AP68366 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBA4AP68366 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBA4AP68366 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms