Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPD52P55327 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPD52P55327 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPD52P55327 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPD52P55327 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPD52P55327 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPD52P55327 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms