Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms